ทหารปัตตานี ติดตามแกะรอยผู้ก่อความไม่สงบ 2 คน ที่หลบหนีคดีมาแฝงตัวเป็นคนงานก่อสร้างในรีสอร์ท ที่อำเภอยะหริ่ง จังหวัดปัตตานี หลังจากปิดล้อม เจ้าหน้าที่ใช้เวลากว่า 10 ชั่วโมงเพื่อเจรจาให้มอบตัว แต่ไม่เป็นผลและยังมีการยิงตอบโต้จนเกิดการปะทะกัน จนผู้ก่อความไม่สงบเสียชีวิตทั้งคู่ 

ผู้บังคับหน่วยเฉพาะกิจปัตตานี พยายามเจรจาให้ผู้ก่อความไม่สงบ ที่อาศัยอยู่ในห้องพักของรีสอร์ทแห่งหนึ่ง อำเภอยะหริ่ง ให้มอบตัว เพื่อลดการต่อสู้ หรือปะทะ ที่อาจก่อให้เกิดการสูญเสีย หลังจากเจ้าหน้าที่ได้พบเบาะแสของผู้ความไม่สงบ 2 คน จึงเข้าปิดล้อมตรวจค้น ตั้งแต่ เวลา 3 นาฬิกา กระทั่งถึง 5 นาฬิกา ที่เข้าเจรจา แต่ไม่เป็นผล

พลตรีคมกฤช รัตนฉายา ผู้บังคับหน่วยเฉพาะกิจ พร้อมตำรวจภูธรจังหวัด และทหารพรานกรมทหารพราน 43 จัดกำลังล้อมห้องพักที่อยู่ทิศตะวันออกของรีสอร์ทไว้ เพื่อกดดันให้วางอาวุธและมอบตัว โดยพลตรีคมกฤช ระบุว่าชายในห้องพักที่ถูกล้อมไว้นี้ คือผู้ที่ก่อเหตุยิงแล้วเผาพ่อค้า 3 สพ ที่เป็นพ่อ ลูกสาว และหลานชาย จนเสียชีวิตขณะไปขายของที่จังหวัดนราธิวาส เมื่อ24 เมษายนที่ผ่านมา ก่อนหลบหนีไปตามที่ต่างๆ และมาถึงที่รีสอร์ทนี้

แม้เจ้าหน้าที่เชิญผู้นำศาสนามาช่วยเจรจา และเป็นพยานให้การมอบตัว แต่ยังมีปืนถูกยิงสวนออกมาเป็นระยะอย่างน้อย 7 ครั้ง ในช่วงเวลา 6 ชั่วโมงของการพยายามคลี่คลายสถานการณ์ เจ้าหน้าที่นำเฮลิคอปเตอร์ขึ้นบินสำรวจมุมสูงและพื้นที่โดยรอบ ขณะที่การพยายามเข้าไปจับตัวพบว่าทั้งสองคน ใช้ฟูกที่นอนเป็นเกราะบังในระหว่างยิงต่อสู้ ทำให้เจ้าหน้าที่ใช้แก็สน้ำตายิงเข้าไปในบ้านก่อน และจากนั้นจึงเกิดการยิงปะทะกันตามมาอีก

เวลา 12 นาฬิกา ที่เสียงปืนสงบลง เจ้าหน้าที่เข้าไปตรวจสอบ จนพบร่างผู้เสียชีวิต 2 คนในห้องพัก พร้อมปืน 2 กระบอก, ระเบิดแบบขว้าง 1 ลูก และกระสุนปืนจำนวนหนึ่ง ผู้เสียชีวิตที่ชื่อนายอัมลัน มะหิเละ มีหมายจับ 4 คดี คือเหตุยิง อส.ต.ประจัน อ.ยะรัง , ยิงอส.ยะหริ่ง , ชิงรถจักรยานยนต์ และคดีฆ่าคนตาย ที่ อ.มายอ ปัตตานี ส่วนผู้เสียชีวิตคนที่สอง คือนายอาดือเระ มันปุเตะ มีหมายจับคดีความมั่นคง 2 คดี

เจ้าของรีสอร์ทให้ข้อมูลเจ้าหน้าที่ว่า ไม่ทราบมาก่อนว่าทั้งคู่เป็นใคร แต่ทั้งคู่มาสมัครงานเป็นคนงานก่อสร้างต่อเติมรีสอร์ท จึงให้พักอาศัยที่ชั้นสองของห้องพักดังกล่าว ขณะเจ้าหน้าที่ระบุว่า ข้อมูลจากชุดปฎิบัติการณ์และแหล่งข่าวในติดตามพฤติกรรมผู้ต้องสงสัย ทำให้ทราบความเคลื่อนไหว กระทั่งติดตามจนพบตัวดังกล่าว